A FUNDENOR tem em seu portfólio centenas de projetos desenvolvidos, atuando na elaboração ou execução ou gestão administrativa, operacional e financeira, sob convênios ou contratos. Estão abaixo listados alguns destes: 

• Diagnóstico da Região Norte Fluminense 
• Plano Diretor de Rodovias Vicinais do Norte Fluminense 
• Desenvolvimento Integrado das Bacias Hidrográficas do NF 
• Execução do PRODENOR – Programa de Desenvolvimento do NF. 
• Plano Estratégico para Aproveitamento Hidroagrícola da Baixada e Tabuleiros do Norte Fluminense 
• Levantamento Pedológico dos Municípios do Norte Fluminense 
• Plano de Desenvolvimento Físico-Territorial-Urbano (para 12 cidades da região) 
• Dimensionamento da Demanda de Gás no Município de Campos dos Goytacazes, com Alternativas de Traçado para Gasoduto. 
• Estrutura Hidrológica das Bacias Hidrográficas da Região Norte/Fluminense 
• Diagnóstico Ambiental do Médio e Baixo Paraíba do Sul 
• Projetos de pesquisas tecnológicas, inovação e extensão conveniados com UENF 
• 1º Ciclo do PEA, “Pescarte” e “Territórios do Petróleo” 
• 3º Ciclo do PEA “Território do Petróleo” 
• Programa Estradas da Produção 
• Programa Moeda Verde – Frutificar 
• Programa Especial de Fomento Agropecuário e Tecnológico – PEFAT/SEAPEC 
• Apoio à organização da Agricultura Familiar do 5º Distrito de São João da Barra 
• Agricultura sob Sistema de Cultivo Protegido em São João da Barra 
• Cultura de Hortaliças sob Sistema Eco-Sustentável em São João da Barra 
• Estudo da Escada de Peixes do Canal Quitinguta